专职PI

徐彦辉 研究员
研究员,博士生导师
E-mail: xuyh@fudan.edu.cnxulab@foxmail.com
实验室主页:http://xulab.fudan.edu.cn
 


工作经历:

  研究员     复旦大学附属肿瘤医院(2017.04~今),生物医学研究院兼职教授
  研究员     复旦大学,生物医学研究院 (2008.10-2017.04)
  副研究员 复旦大学,生物医学研究院 (2008.1-2008.10)
  博士后     美国普林斯顿大学 (2004.11-2007.12) 


教育经历 :

  博士 清华大学,生物科学与技术系 (1999-2004)
  学士 清华大学,生物科学与技术系 (1995-1999)   


所获人才项目 :

  项目名称

项目来源

时间

  长江学者特聘教授

教育部

2015

  国家杰出青年科学基金

国家自然科学基金

2014

  万人计划——青年拔尖人才

中组部

2012

  新世纪优秀人才

教育部

2011

  上海市优秀学术带头人

上海市科委

2014

  曙光学者

上海市教委

2011

  浦江人才计划

上海市科委

2008


所获奖项 :

  所获奖项获奖名称

授予单位

时间

  第十二届上海市自然科学牡丹奖

上海市科学技术委员会

2017

  自然科学一等奖(第一完成人)

教育部

2016

  中国优秀青年科技人才奖(首届)

中国科协

2016

  中国青年科技奖(十四届)

中国科协

2016

  中源协和创新突破奖

中国科学院大学/中源协和公司

2016

  谈家桢生命科学奖(创新奖)

上海市生物医药行业协会

2015

  药明康德生命化学奖(学者奖)

药明康德公司

2015

  树兰医学青年奖

树兰医学奖基金

2015

  上海市青年科技英才奖

上海市科协

2014

  明治生命科学奖(杰出奖)

国家人类基因组南方研究中心

2012

  贝时璋青年生物物理学家奖

中国生物物理学会

2011

  上海市生物物理学科青年科技英才

上海市生物物理学会

2012


研究领域:

  课题组利用生化和结构生物学方法研究表观遗传调控,染色质结构调控及转录机制,DNA损伤修复,肿瘤发生信号通路等关键蛋白质的结构与功能,并开展靶向药物开发。我们过去研究了DNA甲基化关键蛋白(DNMT1,DNMT3,UHRF1,TET1/2/3),组蛋白甲基化修饰调控酶(LSD2,KDM7A)的催化,底物识别及酶活性调节的分子机制,以及DNA甲基化与组蛋白甲基化之间相互调节的机制。我们目前正在开展染色质结构调控,DNA损伤修复等方面蛋白质复合物的结构功能研究。希望揭示这些复杂生命过程的基本原理,并为靶向药物研发提供结构基础。
  课题组长徐彦辉主持和参与多项国家和省部级项目,包括国家重点研发计划(项目首席)、国家自然科学基金重点项目、面上项目、“重大新药创制”专项、上海市科委项目等。迄今为止,已在国内外学术刊物上发表论文近40篇,包括NatureCellMolecular Cell, Genes & Development, Nature Communications, Cell research等。


研究团队:



代表性论著(*为通讯作者):

  1. Chen X, Liu M, Tian Y Li J, Qi Y, Zhao D, Wu Z, Huang M, Wong CCL, Wang HW, Wang J, Yang H*, Xu Y*. Cryo-EM structure of human mTOR complex 2. Cell Res. 2018 Mar 22. doi: 10.1038/s41422-018-0029-3. [Epub ahead of print]
  2. Rao Q, Liu M, Tian Y, Wu Z, Hao Y, Song L, Qin Z, Ding C, Wang HW, Wang J, Xu Y*. Cryo-EM structure of human ATR-ATRIP complex. Cell Res,2018 Feb; 28(2):143-156.
  3. He XD, Gong W, Zhang JN, Nie J, Yao CF, Guo FS, Lin Y, Wu XH, Li F, Li J, Sun WC, Wang ED, An YP, Tang HR, Yan GQ, Yang PY, Wei Y, Mao YZ, Lin PC, Zhao JY, Xu Y*, Xu W*, Zhao SM*. Sensing and Transmitting Intracellular Amino Acid Signals through Reversible Lysine Aminoacylations. Cell Metab, 2018 Jan 9; 27(1):151-166.
  4. Yin X, Liu M, Tian Y, Wang J, Xu Y*. Cryo-EM structure of human DNA-PK holoenzyme. Cell Res, 2017 Nov; 27(11):1341-1350.
  5. Guo, X., Wang, L., Li, J., Ding, Z., Xiao, J., Yin, X., He, S., Shi, P., Dong, L., Li, G., Tian, C., Wang, J., Cong, Y., and Xu, Y.* Structural insight into autoinhibition and histone H3-induced activation of DNMT3A. Nature, 2015 Jan 29; 517(7536):640-4. Reviewed by: Faculty of 1000
  6. Hu L, Lu J, Cheng J, Rao Q, Li Z, Hou H, Lou Z, Zhang L, Li W, Gong W, Liu M, Sun C, Yin X, Li J, Tan X, Wang P, Wang Y, Fang D, Cui Q, Yang P, He C, Jiang H, Luo C*, Xu, Y.* Structural insight into substrate preference for TET-mediated oxidation. Nature, 2015 Nov 5; 527(7576):118-22.
  7. Hu, L., Li, Z., Cheng, J., Rao, Q., Gong, W., Liu, M., Shi, Y. G., Zhu, J., Wang, P., and Xu, Y.* Crystal structure of TET2-DNA complex: insight into TET-mediated 5mC oxidation. Cell, 2013 Dec 19; 155(7):1545-55.
    Reviewed by: Faculty of 1000, Nature China, Preview in Cell
  8. Yang Y, Yin X, Yang H, Xu, Y.* Histone Demethylase LSD2 Acts as an E3 Ubiquitin Ligase and Inhibits Cancer Cell Growth through Promoting Proteasomal Degradation of OGT. Mol Cell, 2015 Apr 2; 58(1):47-59.
    Highlights in Science Signaling
  9. Cheng J, Yang H, Fang J, Ma L, Gong R, Wang P, Li Z, Xu Y.* Molecular mechanism for USP7-mediated DNMT1 stabilization by acetylation. Nat Commun, 2015 May 11;6:7023.
  10. Fang J, Cheng J, Wang J, Zhang Q, Liu M, Gong R, Wang P, Zhang X, Feng Y, Lan W, Wong J, Yang H, Cao C, Xu, Y.* Hemi-methylated DNA Opens a Closed Conformation of UHRF1 to Facilitate Its Histone Recognition. Nat Commun, 2016 Apr 5; 7:11197.
  11. Fang, R., Chen, F., Dong, Z., Hu, D., Barbera, A. J., Clark, E. A., Fang, J., Yang, Y., Mei, P., Rutenberg, M., Li, Z., Zhang, Y., Xu, Y., Yang, H., Wang, P., Simon, M. D., Zhou, Q., Li, J., Marynick, M. P., Li, X., Lu, H., Kaiser, U. B., Kingston, R. E., Xu, Y.*, and Shi, Y. G.* LSD2/KDM1B and its cofactor NPAC/GLYR1 endow a structural and molecular model for regulation of H3K4 demethylation. Molecular cell, 2013 Feb 7; 49(3):558-70.
    Reviewed by:Nature China
  12. Gong, R., Li, L., Liu, Y., Wang, P., Yang, H., Wang, L., Cheng, J., Guan, K. L.*, and Xu, Y.* Crystal structure of the Gtr1p-Gtr2p complex reveals new insights into the amino acid-induced TORC1 activation. Genes & development, 2011 Aug 15; 25(16):1668-73.
  13. Li, Z., Zhao, B., Wang, P., Chen, F., Dong, Z., Yang, H., Guan, K. L.*, and Xu, Y.* Structural insights into the YAP and TEAD complex. Genes & development, 2010 Feb 1; 24(3):235-40.
  14. Zhu, T., Roundtree, I. A., Wang, P., Wang, X., Wang, L., Sun, C., Tian, Y., Li, J., He, C., and Xu, Y.* Crystal structure of the YTH domain of YTHDF2 reveals mechanism for recognition of N6-methyladenosine. Cell research, 2014 Dec; 24(12):1493-6.
  15. Chen, F., Yang, H., Dong, Z., Fang, J., Wang, P., Zhu, T., Gong, W., Fang, R., Shi, Y. G., Li, Z.*, and Xu, Y.* Structural insight into substrate recognition by histone demethylase LSD2/KDM1b. Cell research, 2013 Feb; 23(2):306-9.
  16. Ma, H., Chen, H., Guo, X., Wang, Z., Sowa, M. E., Zheng, L., Hu, S., Zeng, P., Guo, R., Diao, J., Lan, F., Harper, J. W., Shi, Y. G., Xu, Y.*, and Shi, Y.* M phase phosphorylation of the epigenetic regulator UHRF1 regulates its physical association with the deubiquitylase USP7 and stability. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012 Mar 27; 109(13):4828-33.
  17. Hu, L., Li, Z., Wang, P., Lin, Y., and Xu, Y.* Crystal structure of PHD domain of UHRF1 and insights into recognition of unmodified histone H3 arginine residue 2. Cell research, 2011 Sep; 21(9):1374-8.
  18. Yang, Y., Hu, L., Wang, P., Hou, H., Lin, Y., Liu, Y., Li, Z., Gong, R., Feng, X., Zhou, L., Zhang, W., Dong, Y., Yang, H., Lin, H., Wang, Y., Chen, C. D.*, and Xu, Y.* Structural insights into a dual-specificity histone demethylase ceKDM7A from Caenorhabditis elegans. Cell research, 2010 Aug; 20(8):886-98. [Cover story]
    Reviewed by:Highlights in Cell Research
 
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